Le CA compte 35 membres, à raison de 7 par collège, élus pour 3 ans lors de l'Assemblée Générale. Le Préfet de Région et le Président du Conseil Régional sont membres de droit du CA. Le Conseil d'Administration est chargé d'informer régulièrement les membres de l'Observatoire de l'état d'avancement des travaux et études engagées.
Le CA élit les représentant du Bureau, soit un Président, deux Vice-présidents, un Trésorier et un Trésorier adjoint. L'ADEME assure à ce jour le secrétariat de l'ORDIMIP. Le Délégué Régional de l'ADEME est donc membre de droit du Bureau au poste de Secrétaire. Traditionnellement, la Présidence est assurée par un membre du collège des personnalités qualifiées et les postes de Trésorerie sont dévolus aux industriels. Les collèges des Collectivités et des Associations se partagent la Vice-présidence. Le Bureau est chargé de la gestion quotidienne de l'Observatoire et de la réalisation du programme d'actions engagé.
Les groupes de travail sont créés à l'initiative du CA ou de l'Assemblée Générale. Ils proposent les études et travaux nécessaires à l'objet de l'association, en suivent l'avancement et se prononcent sur les résultats. Chaque groupe de travail est animé par deux pilotes provenant de collèges différents désignés par les instances dirigeantes de l'ORDIMIP. Les pilotes sont par ailleurs invités aux réunions du Bureau élargi, ils ont une voix consultative.
Les groupes de travail actuellement en activité sont les suivants :
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Technique et Réglementation Pilotes : ARPE, DRIRE
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Information, communication Pilote : ARPE
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Etude DIB : gisement et acteurs Pilotes : CCI de Toulouse, ARPE